令狐恩强从事消化病及消化内镜研究、临床、教学及保健工作，紧贴临床一线进行技术与理论创新。他提出的疾病分类、分型，被多个学会采纳写入指南。他定名和完善的消化内镜隧道技术，打破了传统内科和外科的界限，将一些原本由外科手术治 疗的疾病转为内窥镜下，且创伤极小、术后恢复快、费用低、疗效显著；他在消化管道深部脏器损伤治 疗方面处于世界领 先水平。
令狐恩强技术精湛与医德高尚，他钻研技术，有着锲而不舍的韧劲。他心里装着患者，是一位患者可以生死相托的好军医。他是一位经验丰富医术高超的消化内科专家。创新已成为令狐恩强从医之路的主旋律，创新是为了更好地服务患者，是他多年恪守的创新目的和准则。
北京301医院消化科主任医师令狐恩强 常年从事消化疾病的临床诊断与,对消化道急危重抢救,如:消化道出血、肝昏迷、肝破裂、急性胰腺炎、化脓性胆管炎等成功率在93%以上。
令狐恩强说，在2010年前后，我国提出消化内镜诊治新模式的概念，来践行早诊早治的理念。一方面是把检查切入点从有症状期提前到无症状期，另一方面则是形成以消化内镜治 疗为主，外科手术切除为辅，放化疗为补充的一套全新的治 疗概念。该理念保证了患者能在早期就能被发现，并进行有效的内镜下治 疗，具有良好的社会意义和经济效益。