污水井的清理是其中的一项重要任务。由于污水井中常常会有硬泥和杂物沉积，这不仅会影响污水排放，还会对周围的环境造成污染。因此，定期清理污水井底部的硬泥和杂物是非常必要的。
在清理过程中，需要先将污水井表面的杂物和落叶等清除干净，然后使用铁锹等工具将井底部的硬泥和杂物挖掘出来。如果遇到硬泥和杂物比较难以清理的情况，可以使用高压水枪进行冲洗。在清理过程中需要注意，避免因操作不当导致的意外事故。
主要截留含虫卵较多的粪便，粪便经发酵分解，松散的粪块因发酵膨胀而浮升，比重大的下沉，因而形成上浮的粪皮、中层的粪液和下沉的粪渣。利用寄生虫的比重大于粪尿混合液的原理使其自然沉降于化粪池底部。利用粪液的浸泡和翻动化解粪块使其液化并截留粪渣于池底。
贮粪池由二根过粪管连通的三个格室的密封池组成。根据其主要功能依次可命名为截留沉淀与发酵池、再次发酵池和贮粪池。三池之间由过粪管连接。有斜插管及倒U形、倒L形管等，但以斜插管为。过粪管采用内径为100～150mmPVC塑料管为宜，也可以用水泥预制、陶管等其它材料、要求内壁光滑。为防止堵塞，考虑粪池的大小与流量，可适当增加过粪管的数量。