从承兑人角度
两者承兑人不同。从定义上理解，我们不难发现商业汇票作为一种有价证券，可以在真实贸易背景下进行交易流通。银行承兑汇票是由银行承兑的，信用好，承兑性强。银行承兑汇票经银行承兑到期无条件付款。对企业来说，收到银行承兑汇票，就如同收到了现金。流通性强，灵活性高。银行承兑汇票可以背书转让，也可以申请贴现，不会占压企业的资金。商业承兑汇票是企业承兑的。但是有些企业为了让交易对手接受自己的商业承兑汇票，会请银行帮忙，做保证兑付，就是在商业承兑汇票上盖上银行的承兑章，达到和银行承兑汇票一样的效果。
从功能角度
功能上两者相似，但商业承兑汇票功能是通过银行承诺贴现加强了票据的变现能力和流通性。与银行承兑汇票相比，商业承兑汇票的付款人一般是企业，由于我国的商业信用体系尚未完全建立，商业承兑汇票贴现较银行汇票难度大，不容易被持票人接受。如果银行在商业承兑汇票后加具保贴函，持票人得到银行贴现的承诺，可以在票据未到期前，通过向银行申请贴现提前融通资金。票据到期后，由银行向承兑人提示付款。因此，附加保贴函后的商业承兑汇票的被接受性大大提高，基本功能上可视同于银行承兑汇票，可作为企业用于支付的资金融通的重要信用工具。
从信用角度
两者信用不同，银行承兑汇票是指在承兑银行开立存款账户，资信状况良好的法人组织签发，并由开户银行承诺到期付款的一种票据。它是企业间相互结算的重要形式之一。一般来讲，银行承兑汇票的信用和支付效率要优于商业承兑汇票。因为大家都认为银行比较靠谱。但并不完全一样，有时候一张农商行开具的银行承兑汇票，就没有一张由大型上市或者国企公司开出的商业承兑汇票的信用高。